Bundesminister Dr. Karsten Wildberger leitet das Ministerium in eigener Verantwortung innerhalb der vom Bundeskanzler vorgegebenen Richtlinien. Unterstützt wird er dabei vom beamteten Staatssekretär. Sie bilden zusammen die Hausleitung, denen die Abteilungen und Referate des BMDS sowie dessen nachgeordneten Behörden unterstehen. Ebenfalls zur Hausleitung gehören die Parlamentarischen Staatssekretäre, die den Minister bei seinen politischen Aufgaben unterstützen.
